التعاون الثنائي:
يرتبط المكتب بعلاقة تعاون وثيقة مع العديد من نظرائه الدوليين، في مجال سلامة الأغذية، حيث قام منذ انشائه سنة 2010، بالتوقيع على أزيد من عشرين اتفاقية مع عدة مؤسسات: Rosselkhoznadzor (روسيا)، AFSCA (بلجيكا)، DGAL (فرنسا)، BVL، BFR (ألمانيا)، NVWA (هولندا)، GACC (الصين)، SFDA (المملكة العربية السعودية)، ASAE (البرتغال) …
تستهدف الاتفاقيات ذات الطابع التقني، توفير الدعم ونقل الخبرات وكذلك تبادل المعلومات، مما يسمح بالتطوير المستمر لمهارات الموارد البشرية للمكتب
بالإضافة إلى ذلك، يقوم المكتب سنوياً بتوقيع وتنفيذ العديد من الاتفاقيات في مجال الصحة والصحة النباتية (روسيا والصين والمملكة العربية السعودية، إلخ) التي تؤطر السلامة الصحية لتجارة الأغدية بين المملكة المغربية وبقية العالم. كما يشارك المكتب كعضو فعال في مفاوضات اتفاقيات التجارة الحرة (الولايات المتحدة…)
كما يقوم المكتب بتبادل خبراته مع دول الجنوب تماشياً مع التوجهات الاستراتيجية للمملكة. حيث يستقبل المكتب أطر ومسؤولين و من عدة دول أفريقية، في إطار فعاليات مختلفة (ورش عمل، ندوات، دورات تدريبية، إلخ)
التعاون متعدد الأطراف:
يشارك المكتب في عدة مشاريع وبرامج بالتعاون مع شركاؤه متعددو الأطراف (البنك الدولي ، منظمة الأغذية والزراعة ، منظمة الأمم المتحدة للتنمية الصناعية ، الوكالة الدولية للطاقة الذرية ، الاتحاد الأوروبي ، إلخ) ؛
تتنوع الأنشطة التي تدخل في إطار هذه المشاريع والبرامج، وتشمل على وجه الخصوص:
التبادل المستمر للمعلومات والمعارف الجديدة.
دعم المكتب بالخبرات الأجنبية.
رفع مستوى المهارات من خلال دورات تدريبية في الخارج.
المشاركة في التظاهرات العلميةالدولية.
تنظيم فعاليات متنوعة في المغرب (ورش عمل ، ندوات … الخ).
بالإضافة إلى ذلك ، يعتبر المكتب نقطة الاتصال الوطنية لمدونة القانون الغذائي ؛ لجنة الصحة والصحة النباتية التابعة لمنظمة التجارة العالمية ؛ الاتفاقية الدولية لوقاية النباتات ، المنظمة العالمية لصحة الحيوان ، المنظمة الدولية للكروم والنبيذ.