A/ Plan de surveillance des métaux lourds et des hydrocarbures aromatiques polycycliques dans les les produits de la pêche : 
Ce plan concerne la recherche des métaux lourds (Plomb, Cadmium et Mercure) et des hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) dans les produits de la pêche débarqués dans les différents ports du Royaume sur les côtes méditerranéenne et atlantique.
Ce plan a été mis en place depuis juillet 2006.

B/ Plan de surveillance des résidus et des contaminants dans les produits de l'aquaculture :
Ce plan concerne la recherche des résidus des médicaments vétérinaires, des substances interdites dont les hormones, les pesticides organochlorés et organophosphorés, des contaminants de l'environnement (métaux lourds et PCB), des mycotoxines et des colorants dans les élevages de piscicultures marines et continentales.
Ce plan a été mis en place depuis 2001.

C/ Plan de surveillance des résidus et des contaminants chez les ovins : 
Ce plan concerne la recherche des résidus des médicaments vétérinaires, des substances interdites dont les hormones, des pesticides organochlorés et organophosphorés, des contaminants de l'environnements (métaux lourds et PCB) et des mycotoxines dans les abattoirs du Royaume.
Ce plan a été mis en place depuis 2001.

D/ Plan de surveillance zoo sanitaire des maladies des mollusques bivalves et des poissons d'aquaculture :
La mise en place d'un système de surveillance des maladies des poissons d'aquaculture et des mollusques bivalves au Maroc a comme objectifs :

• La connaissance de l'état de santé des mollusques bivalves et des poissons en élevage par :

-  Le suivi des maladies régies par la législation et la réglementation nationale ou internationale (Organisation Mondiale de la Santé Animale et Union Européenne);
-  La surveillance de base des populations de poissons et des mollusques bivalves en élevage ;

• L'étude des cas cliniques de maladies affectant les poissons et des mollusques bivalves en élevage.
• Une meilleure connaissance des maladies des poissons et des mollusques bivalves par l'épidémiosurveillance et l'épidémiovigilance.
• L'étude des moyens de diminuer l'impact des agents infectieux et la surveillance de leur évolution.
• Le contrôle des transferts des poissons et des mollusques bivalves à l'intérieur du pays et avec les autres pays.